- AutorIn
- Diplom-Informatiker (Universität) Gerd Anders
- Titel
- Informatik-gestützte Fallstudie zur Analyse von Proteinstrukturen am Beispiel der Pepsinresistenz von Interleukin-8
- Zitierfähige Url:
- https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bsz:15-qucosa2-332059
- Datum der Einreichung
- 05.03.2018
- Datum der Verteidigung
- 06.02.2019
- Abstract (DE)
- Diese Publikationspromotion implementiert und bewertet hauptsächlich algorithmische Verfahren für die strukturelle Bioinformatik im Kontext von Konzeptstudien (proof of concepts). Bei der Kombination dieser Verfahren steht insbesondere deren (struktur-)biologische Eignung zur Analyse von Protein(struktur)en im Vordergrund. Die Datengrundlage bilden Proteinstrukturen, welche weltweit in Laboren experimentell ermittelt werden. Zuerst wird der Aufbau einer Datenbank-gestützten Infrastruktur - genannt PDB2 - für die Verwaltung von Proteinstrukturdaten der Protein Data Bank (PDB) beschrieben. Anschließend ein vor allem auf geometric Hashing basierendes Verfahren zur Analyse von Proteinstrukturen vorgestellt. Zuletzt ein auf dem o. g. Verfahren ein konkretes Fallbeispiel unter Verwendung von Interleukin-8 (IL8) im Detail, d.h. auch experimentell untersucht, und die Ergebnisse vorgestellt.
- Verweis
- Managing the Protein Data Bank with DB2 pureXML
Link: https://www.ibm.com/developerworks/data/library/techarticle/dm-1109proteindatadb2purexml/index.html - The Intrinsic Pepsin Resistance of Interleukin-8 Can be Explained from a Combined Bioinformatical and Experimental Approach
Link: https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/7581054
DOI: https://doi.org/10.1109/TCBB.2016.2614821 - Freie Schlagwörter (DE)
- Bioinformatik, Protein, PDB, Datenbank, Interleukin
- Klassifikation (DDC)
- 610
- Den akademischen Grad verleihende / prüfende Institution
- Universität Leipzig, Leipzig
- Version / Begutachtungsstatus
- angenommene Version / Postprint / Autorenversion
- URN Qucosa
- urn:nbn:de:bsz:15-qucosa2-332059
- Veröffentlichungsdatum Qucosa
- 18.02.2019
- Dokumenttyp
- Dissertation
- Sprache des Dokumentes
- Deutsch
- Inhaltsverzeichnis
I Einführung 1. Einleitung und Zielstellungen 2. PDB2 - eine Infrastruktur für Daten der Protein Data Bank II Ausgewählte Publikationen III Zusammenfassung IV Anhang Literaturverzeichnis A Erklärung über die eigenständige Abfassung der Arbeit B Beruflicher Werdegang C Publikationen D Danksagung