Integration of biomarker analysis in tumor tissue with conventional clinical and pathological diagnostics could provide a better insight into the prognosis of ovarian cancer patients. In this research project, a new technique for RNA isolation from formalin-fixed paraffin- embedded tissue (FFPE) followed by real time RT-PCR was used to quantitatively assess potential prognostic biomarkers in ovarian cancer. Furthermore, biomarker expression was evaluated at the protein level by immunohistochemistry. The biomarkers studied included: topoisomerase II alpha (Top IIα), multidrug resistance-associated protein 1 (MRP1), insulin-like growth factor-II mRNA binding protein 3 (IMP3), estrogen receptor alpha (ERα) and Dicer. Biomarker expression was associated with patient survival and with clinicopathological variables. A positive correlation between expression of ERα, Dicer and IMP3 with overall survival times was observed, whereas Top IIα and MRP1 expression was linked to an unfavourable prognosis. The findings indicate the prognostic value of these biomarkers in ovarian cancer and suggest their contribution to molecular events underlying ovarian cancer. Furthermore, we provide data on the validation of the assessment of biomarkers at the RNA level in FFPE tissue. Molecular biomarker evaluation may help assess patients’ risk profile and planning individually-tailored therapy.
Die Verbindung von Biomarkeranalyse im Tumorgewebe mit konventioneller klinischer und pathologischer Diagnostik verspricht eine genauere Prognoseabschätzung bei Ovarialkarzinompatientinnen. Im hier vorgestellten Forschnugsprojekt wurde eine neue Technik zur RNA-Isolation aus Formalin- fixiertem, Paraffin-eingebetteten (FFPE) Gewebe und Analyse mittels real time RT-PCR verwendet, um quantitativ potentielle prognostische Marker im Ovarialkarzinom zu bestimmen. Außerdem wurde die Proteinexpression dieser Marker mittels Immunhistochemie untersucht. Die untersuchten Biomarker waren: Topoisomerase II alpha (Top IIα), Multidrug resistance-associated protein 1 (MRP1), Insulin-like growth factor-II mRNA binding protein 3 (IMP3), Östrogenrezeptor alpha (ERα) und Dicer. Die Expression der genannten Biomarker war mit der Überlebenszeit und verschiedenen klinisch-pathologischen Parametern assoziiert. Hierbei wurde eine positive Assoziation zwischen der Expression von ERα, Dicer und IMP3 und der Prognose gefunden, wohingegen die Expression von Top IIα und MRP1 mit einer schlechten Prognose verbunden war. Diese Ergebnisse zeigen den prognostischen Wert dieser molekularen Marker beim Ovarialkarzinom und weisen darauf hin, daß die betreffenden Moleküle an der Tumorentstehung und -progression beteiligt sein könnten. Zudem wurde einen neue Methode der Biomarkeranalyse auf RNA Ebene im FFPE Gewebe validiert. Die Expressionsanalyse dieser Biomarker könnte dazu beitragen, die Patientenprognose besser abzuschätzen und damit eine individuelle Therapie zu planen.
