Phylogenetischer Vergleich von chromosomal- und plasmid-kodierten Genabschnitten in enterohämorrhagischen Escherichia coli

In einem repräsentativen Kollektiv HUS-assoziierter EHEC wurde untersucht, in welchem Verhältnis sich das Plasmid und das Chromosom zueinander entwickelt haben. Dazu wurden 41 Stämme hinsichtlich der plasmid-kodierten Gene EHEC-hlyA und espP untersucht und sequenziert. Diese plasmidalen Sequenzen so...

Verfasser: Waldmann, Karsten
Weitere Beteiligte: Mellmann, Alexander (Gutachter)
FB/Einrichtung:FB 05: Medizinische Fakultät
Dokumenttypen:Dissertation/Habilitation
Medientypen:Text
Publikation in MIAMI:17.04.2014
Datum der letzten Änderung:27.07.2015
Angaben zur Ausgabe:[Electronic ed.]
Schlagwörter:Escherichia coli; EHEC-hlyA; espP; Chromosom; Plasmid; Phylogenie
Fachgebiet (DDC):610: Medizin und Gesundheit
Lizenz:InC 1.0
Sprache:Deutsch
Format:PDF-Dokument
URN:urn:nbn:de:hbz:6-73359418156
Permalink:https://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:hbz:6-73359418156
Onlinezugriff:diss_waldmann.pdf

In einem repräsentativen Kollektiv HUS-assoziierter EHEC wurde untersucht, in welchem Verhältnis sich das Plasmid und das Chromosom zueinander entwickelt haben. Dazu wurden 41 Stämme hinsichtlich der plasmid-kodierten Gene EHEC-hlyA und espP untersucht und sequenziert. Diese plasmidalen Sequenzen sowie die konkatenierten Sequenzen der sieben chromosomalen Haushaltsgene aus dem E. coli-MLST-Schema wurden auf ihre Phylogenie untersucht um einen Vergleich der Entwicklung durchzuführen. Von den 42 untersuchten HUSEC-Stämmen waren 23 EHEC-hlyA-positiv und 14 espP-positiv, darunter 12 sowohl EHEC-hlyA als auch espP-positiv. Der Vergleich der phylogenetischen Bäume ergab, dass die Struktur der plasmidalen Sequenzen gegenüber den chromosomalen Sequenzen keine signifikanten Übereinstimmungen aufweisen. Zusammenfassend haben sich somit die chromosomalen Gene unabhängig von den plasmidalen Genen entwickelt.